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PKU-EMBL/Data-Visualization-and-Analysis-Methods

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数据可视化与分析方法 | Data Visualization and Analysis Methods

从数据到证据,从图形到洞见:一门强调可复现分析与研究型视觉表达的方法课程。

PKU EMBL Yu's Lab

PKU EMBL · Course Documentation · 2025–2026 Fall

本仓库汇总 Data Visualization and Analysis Methods(DVAM)课程文档、课程项目要求与学生作品。课程以 Python 与 R 为主要技术栈,强调从研究问题、数据质量和视觉编码出发,完成可复现、可解释、可交流的数据分析。

This repository contains the documentation, final-project guidance, and student work for the Data Visualization and Analysis Methods course at PKU EMBL.

Documentation

文档使用 MkDocs Material 构建,并已按 Read the Docs 的标准构建配置组织。

Final project

Requirements

  1. 选题可结合团队专业背景,但需形成明确的研究问题;
  2. 每组最多 4 人;
  3. 使用有研究意义的数据集完成可视化与分析;
  4. 提交详细 README 与技术报告;
  5. 用户友好的项目网站为可选交付;
  6. 提交由全体成员确认并签署的贡献表;
  7. Fork 本仓库,并通过 Pull Request 添加团队项目外部链接。

Required materials

未提交签署版贡献表时,项目材料不完整。贡献比例须合计 100%,外部数据、代码、文字和图形必须按学术规范引用。

Student projects

Fall 2025–2026

Group Project Team
G1 Sweden Biodiversity and Climate Information Facility Interactive Visualization Platform 姜肇瑞、徐子洋、程梓雄、范竞元
G2 Beijing Air Quality Visualization and Forecast Platform 李忠远、史恒震、肖晟
G3 深港水环境耐药细菌的分布特征及其对理化因子的响应机制 朱慧芬、程淋、孔子希
G4 雨水利用管理系统 · Rainwater Harvest OS 刘正星、王伟光、冯贤彬
G5 秸秆资源化利用方式生命周期碳减排效果评价 李筱、童卓琳、李昊
G6 Group 6 Final Project 刘含章、林阳杰、申领东
G7 冻层湖泊中甲烷排放的温度依赖性研究 苏治平、符育、张一腾
G8 小鼠蛋白质相互作用网络可视化分析 徐永祺、刘祥瑞、赵张欣悦
G9 MOF 材料 CO₂ 吸附与结构特征、元素组成的相关性分析 吴晓倩、古思莹、杨晨、白亚冉
G10 City Air Quality Analytics Dashboard 陈静婷、黄宝仪、雷涵越
G11 金属硫化物材料稳定性与电子性质研究 刘焕敏、郑智文、年旭丰、蒋坤宏
G12 印度手机用户行为可视化平台 何俊辉、张骋旭、陆胤、陈安杰
G13 珠三角九市大气污染时空分布特征及影响因素分析 毕佳琪、王舒妍、杨宗贵
G14 基于 Myctobase 的南大洋中层鱼类采样数据分析 马欣雨、周楠、郑婷玮
G15 RNA-Seq 数据分析及生物学信息可视化 应瑛琦、和菊芳、王皓坤
G17 Chinese National Geographic Products 石金强、宋帅臻
G18 交通边界对即时配送的阻碍效应——以北京市为例 范思琪、陈妮、徐静雯、王骞若

本学期没有 G16,因此共归档 17 个项目。

Contributing

  1. Fork this repository;
  2. Create a focused branch for your documentation or project-index update;
  3. Keep project titles, links, team names, and source information complete;
  4. Submit a Pull Request with a concise description of the change.

For documentation problems, open a GitHub Issue.

Citation

@misc{PKU_EMBL_DVAM,
  author       = {{PKU-EMBL}},
  title        = {Data Visualization and Analysis Methods},
  year         = {2026},
  publisher    = {GitHub},
  howpublished = {\url{https://github.com/PKU-EMBL/Data-Visualization-and-Analysis-Methods}}
}

License

See LICENSE for details.

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