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Author: Helioszjr

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 Este projeto foi proposto na disciplina FIT 678 - Análise de dados genéticos no melhoramento de plantas da UFV, ministrada pelo Prof. Guilherme da Silva Pereira.
 
 O propósito desse trabalho foi realizar análises de ligação e de QTL em um conjunto de dados de milho. O objetivo é realizar uma Análise de ligação I: segregação de marcadores, cálculo da fração de recombinação dois-pontos, e formação dos grupos de ligação; Análise de ligação II: ordenação dos marcadores; Análise de QTL I: análise de marcas individuais; Análise de QTL II: mapeamento por intervalo;  Análise de QTL III: mapeamento por intervalo composto e Análise de QTL IV: mapeamento por múltiplos intervalos.
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+# Referências Bibliográficas para se aprofundar
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+1. Broman, K. W. (2008). *New functions for exploring multiple-QTL models*. Documento técnico complementar ao pacote **R/qtl**. Última revisão em 26 de outubro de 2010.
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+2. Silva, L. D. C. E., & Zeng, Z.-B. (2010). Current Progress on Statistical Methods for Mapping Quantitative Trait Loci from Inbred Line Crosses. *Journal of Biopharmaceutical Statistics*, 20(2), 454–481. https://doi.org/10.1080/10543400903572845
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+3. Zeng, Z.-B. (1994). Precision Mapping of Quantitative Trait Loci. *Genetics*, 136(4), 1457–1468.
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+4. Lander, E. S., & Botstein, D. (1989). Mapping Mendelian Factors Underlying Quantitative Traits Using RFLP Linkage Maps. *Genetics*, 121(1), 185–199.
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+5. Eddy, S. R. (2004). What is a Hidden Markov Model? *Nature Biotechnology*, 22(10), 1315–1316.
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+6. Do, C. B., & Batzoglou, S. (2008). What is the Expectation Maximization Algorithm? *Nature Biotechnology*, 26(8), 897–899.